Mac OS X, temelinde UNIX tarzı bir alt sisteme (subsystem) sahiptir. Bu tarz bir sistemde, sabit diskinizde bulunan bütün dosyaların, onları hangi kullanıların okuyabileceği, üzerine yazabileceği ya da çalıştırabileceğini belirten izin bilgileri vardır.
Mac OS X'de pekçok yüklemeyi paket dosyalarından (.pkg) yaparsınız. Bir paket kullanılarak bir şey yüklendiği zaman, System altındaki bir klasörde bir .bom dosyası kaydedilir. Herbir .bom dosyası ilgili paket tarafından yüklenen dosyaların listesini ve onların izin bilgilerini içerir.
OnyX'i kullanarak izinleri doğrulayıp onardığınızda, bütün .bom dosyaları gözden geçirilir ve dosyaların orijinal izinlerine göre doğru ayarlarda olup olmadığı kontrol edilir. Eğer izinler farklıysa OnyX tarafından düzeltilir. Eğer /Library/Receipts/ klasöründen .bom dosyalarını kaldırırsanız, paketler kullanılarak yüklenen dosyaların izinleri doğrulanamaz ya da onarılamaz. Bu yüzden /Library/Receipts/ klasörünün içeriğine dokunmamalısınız.
OnyX bu dosyaların izinlerini onarır ama Ana Klasörünüz altındaki belgelerin izinlerini onarmayacaktır.