L'historique stocke la date, l'heure et la description de chacune des opérations que vous effectuez dans OnyX. Vous pouvez choisir le nombre de lignes à afficher en saisissant le nombre souhaité dans le champ correspondant puis en cliquant sur le bouton Recharger. Vous pouvez également afficher le fichier dans une fenêtre du Finder et effacer son contenu.
Par défaut, cet historique est effacé automatiquement lorsque vous quittez OnyX. Vous pouvez cependant choisir de ne pas le faire en décochant la case "Effacer l'historique en quittant l'application" dans l'onglet "Messages et historique" des préférences d'OnyX.